১। দীর্ঘসূত্রিতা: আমলাতন্ত্রের অন্যতম প্রধান ত্রুটি হলো এর দীর্ঘসূত্রিতা। কোনো কাজ সম্পন্ন করতে এখানে অপ্রয়োজনীয় সময় লাগে। একটি ফাইলের এক টেবিল থেকে অন্য টেবিলে যেতে মাসের পর মাস লেগে যায়। এর কারণ হলো, প্রতিটি স্তরে অনুমোদনের জন্য এক জটিল এবং সময়সাপেক্ষ প্রক্রিয়া অনুসরণ করা হয়। এই দীর্ঘ প্রক্রিয়ার ফলে সাধারণ মানুষ তাদের প্রাপ্য সেবা থেকে বঞ্চিত হয় এবং জরুরি কাজও সময়ে সম্পন্ন হয় না। এই ধীর গতিশীলতা কেবল জনগণের দুর্ভোগ বাড়ায় না, বরং দেশের অর্থনৈতিক উন্নয়নকেও বাধাগ্রস্ত করে।

২। স্বজনপ্রীতি ও দুর্নীতি: আমলাতন্ত্রের গভীরে বাসা বেঁধে আছে স্বজনপ্রীতি ও দুর্নীতি। নিয়ম-কানুনকে উপেক্ষা করে ব্যক্তিগত সম্পর্ক বা আর্থিক লেনদেনের মাধ্যমে কাজ হাসিল করার প্রবণতা এখানে ব্যাপকভাবে বিদ্যমান। অনেক সময় যোগ্য ব্যক্তিরা বঞ্চিত হন এবং অযোগ্য ব্যক্তিরা নিয়োগ বা পদোন্নতি পান। দুর্নীতির কারণে জনসেবার মান হ্রাস পায় এবং সরকারি অর্থের অপচয় হয়। এটি শুধু প্রশাসনের স্বচ্ছতাকেই নষ্ট করে না, বরং সাধারণ মানুষের মধ্যে সরকারি ব্যবস্থার প্রতি অনাস্থা তৈরি করে।

৩। ক্ষমতার অপব্যবহার: ক্ষমতার অপব্যবহার আমলাতন্ত্রের একটি সাধারণ সমস্যা। আমলারা প্রায়শই তাদের হাতে থাকা ক্ষমতাকে ব্যক্তিগত স্বার্থে ব্যবহার করেন। নিয়ম-কানুনকে নিজেদের সুবিধামতো ব্যাখ্যা করা বা সাধারণ মানুষকে হয়রানি করার প্রবণতা দেখা যায়। এই ধরনের অপব্যবহার জনগণের অধিকারকে ক্ষুণ্ণ করে এবং সমাজে এক ধরনের ভয়ের পরিবেশ তৈরি করে। যখন একজন কর্মকর্তা মনে করেন যে তিনি জবাবদিহিতার ঊর্ধ্বে, তখন ক্ষমতার অপব্যবহার আরও বেড়ে যায়।