১। আধুনিক শিক্ষা: আলীগড় আন্দোলনের প্রধান লক্ষ্য ছিল মুসলিমদের মধ্যে আধুনিক পাশ্চাত্য শিক্ষা ছড়িয়ে দেওয়া। স্যার সৈয়দ আহমদ খান বুঝতে পেরেছিলেন যে শুধুমাত্র প্রথাগত মাদ্রাসাশিক্ষা দিয়ে প্রতিযোগিতামূলক বিশ্বে টিকে থাকা সম্ভব নয়। তাই তিনি মুসলিমদের বিজ্ঞান, ইংরেজি এবং অন্যান্য আধুনিক বিষয়ে জ্ঞানার্জনের জন্য উৎসাহিত করেন। তার প্রতিষ্ঠিত মোহামেডান অ্যাংলো-ওরিয়েন্টাল কলেজ, যা পরবর্তীতে আলীগড় মুসলিম ইউনিভার্সিটিতে রূপান্তরিত হয়, আধুনিক শিক্ষার এক প্রধান কেন্দ্রে পরিণত হয়। এই প্রতিষ্ঠান থেকে অসংখ্য শিক্ষিত মুসলিম বের হয়ে আসে যারা সমাজের বিভিন্ন ক্ষেত্রে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে।

২। ধর্মীয় সংস্কার: আলীগড় আন্দোলন মুসলিমদের ধর্মীয় গোঁড়ামি দূর করতেও কাজ করেছে। স্যার সৈয়দ আহমদ খান ইসলামের মূলনীতিগুলিকে আধুনিক বিজ্ঞানের দৃষ্টিকোণ থেকে ব্যাখ্যা করার চেষ্টা করেন। তিনি বিশ্বাস করতেন যে ইসলাম প্রগতিশীল এবং আধুনিক চিন্তাভাবনার সঙ্গে সামঞ্জস্যপূর্ণ। তার এই উদার দৃষ্টিভঙ্গি অনেক মুসলিমকে ধর্মীয় রক্ষণশীলতা থেকে বেরিয়ে আসতে সাহায্য করে। তিনি ইসলামের সঠিক ব্যাখ্যা দিয়ে মুসলিমদের মধ্যে কুসংস্কার দূর করার চেষ্টা করেন এবং যুক্তি ও বিজ্ঞানের ভিত্তিতে ধর্মীয় বিশ্বাসকে শক্তিশালী করতে উৎসাহিত করেন। 

৩। রাজনৈতিক সচেতনতা: এই আন্দোলন মুসলিমদের মধ্যে রাজনৈতিক সচেতনতা বৃদ্ধিতেও সহায়ক ছিল। যদিও স্যার সৈয়দ আহমদ খান প্রাথমিকভাবে রাজনীতি থেকে দূরে থাকার পরামর্শ দিয়েছিলেন, তার উদ্দেশ্য ছিল মুসলিমদের আগে শিক্ষাগত ও অর্থনৈতিকভাবে শক্তিশালী করা। তিনি বিশ্বাস করতেন যে শিক্ষা ছাড়া রাজনীতিতে অংশগ্রহণ করলে তা ফলপ্রসূ হবে না। কিন্তু তার প্রতিষ্ঠিত শিক্ষাপ্রতিষ্ঠানগুলি থেকে যে শিক্ষিত শ্রেণী তৈরি হয়, তারাই পরবর্তীকালে মুসলিম লীগের মতো রাজনৈতিক দল গঠন করে এবং মুসলিমদের রাজনৈতিক অধিকার আদায়ে অগ্রণী ভূমিকা পালন করে।